秦蒼財務整理了以下針對不同情況說明，非上市有限責任公司股東轉讓涉及的稅負問題：
　　第一種情況：自然人股東轉讓股權。
　　一、個人所得稅：根據2019年1月1日起施行的《個人所得稅法》第六條 關于應納稅所得額的計算的規定“（五）財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用后的余額，為應納稅所得額?！钡谌龡l 個人所得稅的稅率規定“（三）利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十。”這其中，“財產原值”一般由納稅人合法憑證。對未能提供完整、準確的財產原值合法憑證而不能正確計算財產原值的，主管稅務機關可根據當地實際情況核定其財產原值?！昂侠碣M用”是指納稅人在賣出財產的過程中按有關規定所支付的費用，如稅金及附加、中介服務費、資產評估費等（均需要合法有效的憑證）。
　　對申報的計稅依據明顯偏低（如平價和低價轉讓等）且無正當理由的，主管稅務機關可參照每股凈資產或個人股東享有的股權比例所對應的凈資產份額核定。據此，轉讓股權所得屬于“財產轉讓所得”應稅項目，財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用后的余額，為應納稅所得額，按照20%的稅率計征個人所得稅。在實務操作中，“增值部分”即一次個人轉讓股權應納稅所得額，以一次轉讓財產的收入額，減除財產原值和合理費用后的余額。不管分多少次支付，均應合并為一次轉讓股權。對于沒有差額產生的，則不需交稅。
　　二、印花稅。股權轉讓協議應按產權轉移書據繳納印花稅由合同雙方按合同金額萬分之五繳納?！吨腥A人民共和國印花稅暫行條例》 第二條第二款規定“產權轉移書據”，《 印花稅暫行條例施行細則》 第五條規定 “條例第二條所說的產權轉移書據，是指單位和個人產權的買賣、繼承、贈與、交換、分割等所立的書據?！薄〉谑鶙l規定“產權轉移書據由立據人貼花，如未貼或者少貼印花，書據的持有人應負責補貼印花。所立書據以合同方式簽訂的，應由持有書據的各方分別按全額貼花?！惫蓹噢D讓所立的書據屬于印花稅征稅稅目，即 '產權轉移書據'稅目中'財產所有權'。股權轉讓協議應按產權轉移書據繳納印花稅，由合同雙方按合同金額萬分之五繳納。


　　特別注明：對申報的計稅依據明顯偏低且無正當理由的，稅務局可以對土地使用權、房屋、探礦權、采礦權、股權等合計占資產總額比例達50%以上的企業，凈資產額經中介機構評估核實。
　　第二種情況：法人股東轉讓所在有限公司持有的股權。
　　轉讓方為法人時，以取得股權轉讓收入的企業為納稅人申報繳納企業所得稅，具體稅率根據情況有所區別，一般企業所得稅稅率為25%，符合條件的小微企業稅率為20%（利潤低于100萬的小微企業可以減為10%），國家重點扶持的高新技術企業稅率為15%。
　　一、關于法人股股東涉及的企業所得稅
　　一般的股權轉讓，股權轉讓所得稅計算公式：企業應納所得稅額=（轉讓股權收入-取得該股權所發生的成本-轉讓過程中所支付的相關合理費用）×25% =股權轉讓所得×25%。
　　對小型微利企業年應納稅所得額不超過100萬元的部分，減按25%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅；對年應納稅所得額超過100萬元但不超過300萬元的部分，減按50%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅。（財稅〔2019〕13號）